Jako chemikálie vyžadují dezinfekční prostředky zvláštní pozornost v místě jejich skladování. Obecně platí, že dezinfekční prostředky by měly být skladovány na dobře-větraném a suchém místě, mimo přímé sluneční světlo a přístup dětí, jako je chladné a suché místo, jako je sklad, skříň nebo krabice. Kromě toho by se měly uchovávat odděleně od potravin a nápojů, aby se zabránilo náhodnému požití nebo nesprávnému použití. Pokud je dezinfekční prostředek kapalný, měl by být skladován v uzavřené nádobě, aby se zabránilo úniku. Při skladování by měl být uchováván odděleně od ostatních chemikálií, aby se předešlo nehodám.
